本周，美国疾病控制与预防中心在网上公布了去年麻疹病毒传播的首批大型高级基因数据。了解此事的科学家预计，该机构将在未来几周内公布更多数据，从而揭示美国是否已经失去了来之不易的麻疹消除地位。
由于大规模裁员和人员离职，疾控中心团队遭受重创，因此他们搁置了数月数据进行整理。但现在，随着该机构的科学家公布了第一批完整的麻疹病毒基因组——病毒的遗传蓝图——其余的基因组应该会“以更快的速度、更顺畅地公布出来”，斯克里普斯研究所的进化病毒学家克里斯蒂安·安德森说道。安德森并未参与疾控中心的这项工作，但他一直在关注。
美国疾病控制与预防中心（CDC）没有回复凯撒家庭基金会健康新闻（KFF Health News）关于麻疹数据或分析发布时间表的问询。然而，一旦所有数据公开，研究人员就可以进行初步分析 ，从而判断去年美国各地爆发的麻疹疫情是由于各州之间疾病的持续传播，还是由境外输入造成的。如果麻疹持续传播了一年，那就意味着美国失去了“消除麻疹国家”的地位。美国自 2000 年以来一直保持着这一地位，而这一地位反映了一个国家的疫苗接种率：接种两剂麻疹-腮腺炎-风疹疫苗可以预防大多数感染，从而阻止疫情蔓延。
更细致的分析需要数周时间。
安德森说：“我们应该会在四月份看到一份报告，前提是没有政治干预。”
这是美国首次将先进的基因组技术应用于麻疹，由于疫苗的广泛接种，麻疹在25年前已基本从该国消失。
疫苗接种率下降、错误信息传播以及特朗普政府削减预算和应对疫情反应迟缓 ，都助长了麻疹疫情的卷土重来。2025 年，美国 44 个州至少报告了 2285 例麻疹病例，成为三十多年来麻疹疫情最严重的一年。而今年，截至 3 月底，麻疹病例已达 1575 例，预计将超过 2025 年。
研究人员表示，虽然他们对科学研究表示欢迎，但政府的首要任务应该是阻止病毒传播。
安德森说：“我认为对疫情进行全基因组测序非常重要，但我们本来就不应该需要对麻疹进行这种测序，因为我们有一种非常有效且安全的疫苗。”
“我们居然在讨论这件事，真是太荒谬了，”他补充道。
休斯顿一家倡导疫苗接种的非营利组织“免疫伙伴关系” 的执行主任雷卡·拉克什曼南表示，卫生与公众服务部部长小罗伯特·F·肯尼迪和其他政府官员应该对麻疹卷土重来发出警报，并发起全国性的疫苗接种运动。
“我赞赏科学，”她说，“但更紧迫的需求是尽快控制麻疹疫情。”
相反，高层官员淡化了疫情的严重性 ，肯尼迪领导下的疾控中心更是让有关疫苗的错误观念死灰复燃。这包括疾控中心网站上疫苗信息的突然变更，而医学 协会指出，这些变更缺乏证据支持，并且危及生命。
肯尼迪继续推广未经证实的疗法，这些疗法可能会误导家长，让他们以为可以避免接种疫苗而不会产生任何后果。在二月下旬的乔·罗根播客节目中，肯尼迪详细讨论了改善美国民众健康的措施，但只字未提疫苗。他说，预防措施可以包括“整体疗法，或者服用维生素，或者服用维生素 D，你知道，维生素 D 的效果简直神奇。”
美国卫生与公众服务部发言人艾米丽·希利亚德写道：“美国大部分地区麻疹风险仍然很低。”她还写道：“疾控中心已拨款850万美元，用于应对7个爆发麻疹疫情地区的疫情防控工作。”她最后表示：“疾控中心、卫生与公众服务部以及部长都曾明确指出，接种麻疹、腮腺炎、风疹三联疫苗是预防麻疹的最佳方法。”
千人基因组计划
去年 12 月，美国疾病控制与预防中心（CDC）寻求了位于马萨诸塞州剑桥市的博德研究所的帮助，该研究所是美国领先的病毒测序中心之一。德克萨斯州、犹他州和南卡罗来纳州的大规模疫情是由同一种麻疹病毒引起的，该病毒被命名为 D8-9171。但由于这种病毒也在加拿大和墨西哥传播，研究人员需要更多数据来确定它是在美国各州之间传播，还是多次进入美国。
全基因组测序能够提供这类信息，因为病毒会随着时间推移而进化。布罗德研究所病原体监测主任布朗温·麦金尼斯表示，麻疹病毒每经过两到四次人际传播就会发生一次突变。
“这些数据中蕴含着足够的信息，可以帮助我们理清当前的问题，”麦金尼斯说，“其中最主要的问题是，病毒是否在这个国家持续传播。”
麦金尼斯团队加班加点地对 2025 年和 2026 年从各州收集的灭活麻疹病毒的整个基因组进行了测序。
麦金尼斯说：“我们已经采集了大约1000个样本，并将基因组数据陆续发送给了疾控中心。这些数据应该由疾控中心发布。”
美国疾控中心直到 3 月下旬才公布这些基因组序列，当时有 8 个出现在美国国家生物技术信息中心（NCBI）的公共数据库中。到 4 月 1 日，又有 154 个基因组序列上线。
安德森说：“病毒株应该在生产出来后的几周内上传到美国国家生物技术信息中心（NCBI），如果疫情正在爆发，肯定不会超过一个月。”
基因组数据蕴藏着疫情爆发和传播的线索。它使研究人员能够开发检测方法、治疗手段和疫苗，并检测可能逃避这些措施的变异株。
这类数据在新冠疫情中至关重要。中国和澳大利亚的科学家在完成 SARS-CoV-2 基因组测序后不到一周，便于 2020 年 1 月 10 日将其首次发布到网上。“疾控中心绝对不应该花费数月时间，”参与发布首个冠状病毒序列的澳大利亚病毒学家埃迪·霍姆斯说道。
据美国疾病控制与预防中心（CDC）一位科学家向 KFF 健康新闻透露，延误的原因之一是，过去一年来，由于 CDC 大规模裁员和其他动荡，其麻疹实验室严重人手不足。这位研究人员补充说，另一个原因是学习曲线：CDC 和各卫生部门此前从未需要对数百个完整的麻疹病毒基因组进行测序。（KFF 健康新闻同意不透露这位科学家的身份，因为他担心遭到报复。）
与美国疾病控制与预防中心（CDC）相比，犹他州公共卫生实验室迅速共享了麻疹病毒基因组。自 2025 年 1 月 1 日以来，该州在网上公布的约 970 个麻疹病毒基因组中，大部分是由犹他州测序的，这些病毒来自犹他州、亚利桑那州、南卡罗来纳州以及其他愿意共享基因组的州。
“我们只有少量来自德克萨斯州的样本，而且这些样本是在疫情爆发中期采集的，”犹他州卫生与公共服务部的基因组学研究员凯利·奥克森说。奥克森表示，德克萨斯州和犹他州的麻疹病毒基因组相似但又有所不同，这意味着病毒的中间版本缺失。
如果德克萨斯州疫情后期采集的病毒基因组与犹他州的病毒基因组更为接近，那就表明麻疹病毒的传播是持续的，美国可能已经失去了无麻疹状态。疾控中心目前保存的数百个病毒基因组序列或许能解答这个问题。
等待疾控中心
泛美卫生组织免疫规划执行经理丹尼尔·萨拉斯表示，美国疾病控制与预防中心预计将在4月前完成分析。泛美卫生组织与世界卫生组织合作，原计划在4月评估美国的麻疹疫情状况。
他表示，泛美卫生组织将评估推迟到 11 月的年度会议上进行，部分原因是美国疾病控制与预防中心需要更多时间进行基因组分析，部分原因是墨西哥、玻利维亚和其他国家的麻疹状况也在审查之中，为每个国家错开会议效率低下。
萨拉斯说，美国是唯一一个利用全基因组测序来解答麻疹根除问题的国家。通常情况下，各国会根据一小段基因片段对麻疹病毒进行分类，然后假设由同一种病毒引起的大规模疫情之间存在关联。而全基因组测序则能提供更准确的信息。
萨拉斯说：“如果美国能够利用基因组数据填补空白，那将是一项突破。” 他补充道：“但这并不意味着其他国家也能进行这种分析。这需要大量的专业知识和资源。”
用于对基因组进行测序和分析的设备成本高达 10 万美元以上，处理每个样本的成本（包括支付给相关研究人员的费用）通常为每个序列 100 至 500 美元。
“我支持科学，但我们本不应该走到这一步，”北卡罗来纳州儿科学会主席特蕾莎·麦卡锡·弗林说。“我们本不必经历麻疹疫情。”
弗林表示，她经常接到家长的咨询，他们对肯尼迪和反疫苗组织（包括肯尼迪在加入特朗普政府之前创立的组织）散布的错误信息感到担忧。家长们还指出，美国疾病控制与预防中心（CDC）的建议及其网站上的内容与科学共识相悖。
在肯尼迪接任之前， 美国疾病控制与预防中心 (CDC) 的网站以醒目的字体写着“疫苗不会导致自闭症”，并列出了几项发表在顶级科学期刊上的 大型 研究 ，这些研究驳斥了疫苗与发育障碍之间的联系。
去年， 该网站的声明改为“支持疫苗与病毒之间关联的研究被卫生部门忽视”。原本高质量的研究被一份与反疫苗组织有关联的研究人员的报告所取代。美国卫生与公众服务部（HHS）发言人希利亚德在给凯撒家庭基金会健康新闻（KFF Health News）的一封电子邮件中，附和了修改后的网站关于疫苗的说法，无视了大量相关研究。
儿科协会的弗林表示：“疾控中心自己也在散布有关疫苗的错误信息。这件事的严重性怎么强调都不为过。”
尽管美国疾病控制与预防中心代理主任杰伊·巴塔查里亚声称疫苗是预防麻疹的最佳方法，但他本人也曾削弱过疫苗政策。他表示， 今年 1 月备受争议的减少儿童疫苗接种建议数量的决定是基于“黄金标准科学”。事实上，新的接种计划使美国在同类国家中显得格格不入 。希利亚德曾撰文称，更新后的接种计划“使美国的指导方针与国际规范保持一致”。
上个月，美国儿科学会和其他团体提起诉讼，联邦法院暂时宣布该项变更无效。
巴塔查里亚今年没有就麻疹疫情激增向公众或媒体举行简报会，也没有启动疾控中心的应急能力。
“通常情况下，我们会大力推动疫苗接种率低的地区的疫苗接种率上升。我们会大力开展社交媒体宣传，投放疫苗接种广告，”另一位疾控中心科学家说道。由于担心遭到报复，KFF 健康新闻同意不透露其姓名。“疾控中心内部人员想这样做，但该机构的政治领导层不允许疾控中心这样做。”
此外，特朗普政府削减和拖延公共卫生资金，使得地方卫生官员难以保护社区。德克萨斯州达拉斯县卫生与公共服务部主任菲利普·黄表示，去年年初，该州麻疹疫情爆发之际，特朗普政府从各卫生部门收回了约 110 亿美元的拨款，导致该部门损失超过 400 万美元。
他说：“我们失去了27名员工，不得不取消20多项社区疫苗接种活动，其中包括一些疫苗接种率低的学校。与此同时，针对免疫接种的攻击也在不断增加，这使我们的工作更加艰难。”
【 更新： 本文已于美国东部时间 2026 年 4 月 2 日下午 1:05 更新，加入了美国卫生与公众服务部发言人艾米丽·希利亚德的评论。】
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