基因组学和病毒学

 

病毒无处不在。它们是什么?它们又会如何影响人类健康?

大局

 

  • 病毒是由包裹在蛋白质外壳中的遗传物质束组成,能够感染生物体。病毒通过劫持宿主细胞的机制来复制自身,从而造成损害,通常会扰乱细胞的正常功能。

  • 病毒疫苗可以保护个人免受由病毒引起的常见疾病的感染和传播,例如流感、麻疹和新冠肺炎。

什么是病毒?

病毒是介于生物和非生物之间的微小传染性颗粒。它们非常小(百万分之一毫米),即使覆盖一根头发丝的末端,也需要成百上千个病毒才能覆盖。每个病毒都由包裹在蛋白质外壳中的遗传物质组成。感染动植物的病毒还具有一层脂肪分子。病毒无法自行繁殖。相反,病毒通过感染宿主细胞(例如人类、其他动物、植物或细菌)进行复制,劫持宿主的生物机制,并将宿主细胞变成病毒生产工厂。

病毒是由什么构成的?

大多数病毒都具有相同的基本结构:

  • 遗传信息分子,以核酸的形式存在,例如 DNA 或 RNA。

  • 包裹并保护核酸的蛋白质层或外壳。

蛋白质层使病毒能够与它们攻击的细胞外层融合。核酸部分编码基因,这些基因制造病毒发挥功能所必需的蛋白质。这些蛋白质指导病毒复制并执行其他活动, 例如逃避宿主的防御机制 

地球上存在多少种病毒?

研究人员估计地球上存在 10 万亿亿(10 后面跟 30 个零)个病毒。如果将这 10³⁰ 个病毒排列成单列,它们的长度将超过 1 亿光年 (1 光年等于 6 万亿英里)——这相当于地球到距离我们最近的星系——大犬座矮星系——距离的四倍!

但地球上只有极少数病毒会影响人类。已知大约有 200 种不同的病毒会导致人类疾病,其中包括:

  • 获得性免疫缺陷综合征(AIDS)
    病毒病原体:人类免疫缺陷病毒(HIV)

  • 脊髓灰质炎
    病毒病原体:脊髓灰质炎病毒

  • 影响
    病毒因子:甲型、乙型、丙型或丁型流感病毒

  • 2019 冠状病毒病(COVID-19)
    病毒病原体:SARS-CoV-2

If you were to line up all viruses found on Earth, they'd stretch to our nearest galactic neighbor there and back 40 times.

病毒是如何传播的?

 

病毒可以通过多种途径传播,包括:

 

Direct Contact

 

直接接触受感染的生物体,例如被感染西尼罗河病毒的蚊子叮咬。当病毒(和其他病原体)从一个物种传播到另一个物种时,这被称为溢出事件 

 

 

Indirect Contact

 

间接接触感染者,例如通过咳嗽或打喷嚏的人的呼吸道飞沫。

 

空气传播或表面传播,例如接触病毒落地后数分钟至数小时内仍残留有传染性病毒的表面,也会导致病毒传播。

病毒是如何感染生物体的?

 

Virology infection

 

病毒表面有蛋白质,这些蛋白质通常会与宿主细胞表面的特定分子(称为受体)结合。病毒表面的这种分子就像一把钥匙,而宿主细胞的受体就像一把锁。当钥匙与锁匹配时,就打开了一扇门,病毒得以进入细胞。

 

Virology

 

病毒以病毒颗粒的形式进入宿主细胞。一旦病毒颗粒进入宿主细胞,其核酸物质就会干扰宿主细胞的功能,本质上是劫持宿主细胞的蛋白质和其他物质来复制自身。一个受感染的细胞可以释放成百上千个新的病毒颗粒,而每个新产生的病毒颗粒都能够感染另一个细胞。

 

 

病毒一旦成功复制,就会离开宿主细胞感染其他细胞。有些病毒感染不会引起任何症状。然而,当大量病毒颗粒同时感染生物体的细胞时,则可能导致从轻微不适到严重疾病甚至死亡的各种症状。

为什么并非所有病毒都会导致人类疾病?

某些病毒会感染人类并导致疾病,而另一些则不会,其确切原因至今仍是一个生物学谜题。例如,人类感染狂犬病毒通常会死亡。但尽管环状病毒可以感染人类细胞 ,却似乎不会引起疾病。然而,环状病毒感染其他哺乳动物(例如狗和猪)却会导致严重的疾病。

如果病毒很难引起人类疾病,那么为什么有些病毒却能引起人类疾病呢?

某些病毒致病的主要途径有几种。

与使用 DNA 编码信息的病毒相比,使用 RNA 编码信息的病毒往往具有更高的突变率。这些突变使病毒的基因组成更加多样化,从而增加了它们逃避人体免疫系统的可能性和速度。

在其他情况下,两种不同的病毒如果想要攻击同一个宿主细胞 ,就可以交换其核酸区域 ,从而产生混合病毒。

有些病毒能在宿主体内长期存活而不致死,从中获益匪浅。感染时间越长,病毒就有越多的时间适应环境并传播到其他宿主。

流感病毒既能高速变异,又能与其他病毒混合。

每年,科学家都会测量并预测下一个流感季全球流行的流感病毒株类型 。然后,他们会研制出针对这些新毒株的流感疫苗。这些新毒株通常会对其核酸进行一些改变,例如略微改变病毒的蛋白质外壳,从而使病毒在宿主体内的运作方式有所不同。这就是为什么科学家必须针对特定毒株定制疫苗的原因。

基因组学如何帮助我们了解病毒?

基因组学是一门交叉学科,专注于研究生物体的全部核酸物质(例如 DNA 或 RNA),即其基因组。1977 年,研究人员对第一个病毒基因组——φX174(一种攻击细菌的病毒)——进行了测序。

 

Electron micrograph of Phi X 174

 

但自那时以来已经取得了很大进展。例如,截至 2021 年 9 月,已有 11465 个病毒基因组序列可供使用。

出于多种公共卫生原因,获得病毒的完整基因组序列至关重要。了解病毒序列能够帮助研究人员检测宿主生物体内是否存在病毒,并为病毒如何攻击和感染宿主细胞提供线索。

病毒需要利用宿主细胞的功能才能进行复制。抑制宿主细胞的某些功能可能会使病毒变得脆弱。研究人员正在研究病毒及其宿主的基因组序列,以便找到可用于治疗的特定细胞通路。

研究病毒基因组是了解病毒突变及其随时间演变的关键。了解病毒基因组还有助于研究人员追踪疫情爆发,并思考如何更好地治疗病毒感染或接种疫苗。

我们如何才能减少病毒的传播?

佩戴口罩、正确洗手、使用洗手液和保持社交距离可以减少多种病毒的传播。抗病毒药物和疫苗可以消除或减轻病毒引起的疾病的严重程度。

用于治疗细菌感染的药物不能杀死病毒。

病毒疫苗是如何起作用的?

以往的病毒疫苗含有减毒或灭活病毒,这两种形式都无法致病。如今,科学家们又多了一种工具: 利用病毒基因组序列生产疫苗。病毒基因组包含制造病毒蛋白所需的信息,而病毒蛋白正是疫苗的活性成分,能够引发免疫系统的免疫反应。注射后,宿主利用这些 DNA 或 RNA 分子来合成特定的病毒蛋白,免疫系统随后将这些病毒蛋白识别为外来物质,从而激活多种类型的白细胞,产生免疫应答。

 

COVID Vaccine Diagram

 

其中一类白细胞,称为 B 细胞,会产生一种叫做抗体的特殊蛋白质。抗体与病毒表面的分子结合,中和病毒,阻止其复制。

一旦人体成功产生针对某种病毒的抗体,当免疫系统将来再次接触到同一种病毒时,就能做好防御准备。

为什么有些病毒对某些人的影响比其他病毒更大?

病毒对不同人群影响程度不同的确切原因仍在积极研究中。研究人员将其归因于遗传和环境因素的共同作用 。患有糖尿病、心血管疾病或癌症等基础疾病的人更容易受到严重病毒感染的影响。

某些个体还携带特定的基因组变异,这些变异会影响病毒与其身体的相互作用方式。例如,一些相对罕见的基因组变异会使人更容易感染严重的病毒或其他疾病。另一方面,某些基因组变异则能保护特定个体免受病毒感染。研究人员正在持续研究这些机制,包括病毒感染程度与特定基因组变异之间的关系。

我们体内是否存在不致病的病毒 DNA?

是的。人类基因组包含大量曾经存在于病毒中的 DNA。这些病毒序列是过去病毒感染的遗迹。其中大部分序列最初来源于逆转录病毒 ,这类病毒可以将自身基因组的一个拷贝插入宿主生物(例如人类)的 DNA 中。当宿主细胞复制自身基因组时,也会复制病毒 DNA。这些序列可以代代相传,成为人类基因组的永久组成部分(就像化石记录一样)。

目前,这些逆转录病毒的 DNA 约占人类基因组的 9% ,但大多数被认为无法产生新的病毒颗粒。

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最后更新日期: 2021 年 11 月 12 日


基因组学和病毒学 — Genomics and Virology

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